Błony biologiczne są asymetryczne tzn. strona cytoplazmatycna (wewnętrzna) ma z reguły inny skład niż zewnętrzna (wystawiona do otoczenia). Dotyczy to zarówno części lipidowej (asymetria dwuwarstwy lipidowej) jak i białkowej (różne białka powierzchniowe po obu stronach, a także różnice w budowie i funkcji części białek integralnych wystających po każdej ze stron błony). W błonach biologicznych żywych komórek, asymetria lipidów utrzymywana jest przez działanie specjalnych białek - flipaz. Także w sztucznej dwuwarstwie, o ile byłaby na początku asymetryczna, różnice w składzie obu warstw utrzymywałyby się dość długo, ponieważ mechanizm przeskoków molekuł lipidowych miedzy warstwami (flip-flop) jest powolny. Jeżeli jednak z lipidów wyekstahowanych z błon naturalnych formowane są modelowe dwuwarstwy lipidowe, to asymetria jest gubiona już na wstępie: rozkład lipidów w obu warstwach takiej błony, od początku jest przypadkowy, najczęściej jednakowy.